La edición de 2006 de la serie de fútbol americano presenta un nuevo juego de pases en el sistema Quarterback Vision Control: dependiendo de dónde mires y qué tan bueno sea tu QB, tu zona de visión afecta la precisión de tu lanzamiento y te permite precisión. 

Madden NFL 06 presenta un nuevo modo para un jugador: Superstar, que te permite vivir la vida de una sola estrella de la NFL dentro y fuera del campo.