Tom Clancy's: Ghost Recon - Advanced Warfighter 2 se basa en los eventos del primer juego de éxito, para una nueva experiencia de combate táctica. En el año 2014, el creciente conflicto entre leales mexicanos y fuerzas insurgentes lanza a México a una guerra civil a gran escala. Bajo el mando del capitán Scott Mitchell, los Ghosts están llamados a enfrentar una amenaza inminente para los Estados Unidos.

El destino de dos países ahora está en manos de los Ghosts mientras se defienden de un ataque contra suelo estadounidense. Equipados con las armas y la tecnología más vanguardistas, los Ghosts deben luchar a ambos lados de la frontera.