La Familia Kong está de vacaciones en Isla Sol Radiante. Mientras están allí, Diddy nota una banana gigante en una montaña. Cranky le pide a Donkey Kong que lo consiga, y Diddy se une a él.

En la cima de la montaña, King K. Rool y los Kremling capturan una Banana Cristalina de un "alienígena". Planean dominar el universo con ella. Una Nave Espacial Banana aparece, y DK y Diddy luchan contra ella.

Después de que los Kong destruyen la nave espacial, un alienígena banana llamado Platanox sale de ella. Se disculpa por atacar a los Kong, a quienes confundió con los Kremling. Platanox explica cómo K. Rool robó la Banana Cristalina y los Kong emprenden un viaje para recuperarla.