Un día, mientras Wario salía a dar un paseo, se topó con el mundo de Bomberman; Wario comenzó a saquear el mundo en busca de tesoros con la esperanza de hacerse rico. Sólo Bomberman puede detener los codiciosos pero malvados planes de Wario.

Al entrar en el laberinto subterráneo, Wario se encuentra con la resistencia de los Madbombers, expertos en explosivos que tienen algunos trucos de TNT y sorpresas para lanzarle. ¡La batalla se intensifica cuando Wario y Bomberman intentan burlar al otro, nivel tras nivel en un duelo dinamita!